废水生化处理工程的程序一般来说分编制项目建议书、项目可行性研究、项目工程设计、工程和设备招投标、工程施工、竣工验收、运行调试和达标验收等几个步骤。这些建设步骤基本包括了项目建设的全过程,它们也可划分为三个阶段。
第一阶段项目立项阶段。前期工作主要是可行性研究,以可行性研究报告(大型、重要的项目)或工程方案设计(小型、简单的项目)的文件形式表达,主要是论证废水治理项目的必要性、工业技术的先进性与可靠性、工程的经济合理性,为项目的建设提供科学依据。其内容包括项目所在地的自然环境条件(地理、气象、水文地质)、流域社会经济概况,污染源构成、环境质量现状、废水治理要求目标等;废水治理工艺方案比较(工艺技术、技术经济比较)等;工程投资估算及资金筹措(工程投资估算原则与依据、工程投资估算标准、资金筹措与使用计划);工程进度安排;经济评价;存在问题及建议。本阶段以确定项目为中心,一般由政府有关单位编制项目建议书和项目可行性研究报告,通过国家计划部门。和投资银行论证便可获得立项,对于某些小规模项目,只编制废水治理方案设计,并通过投资部门的论证便可立项。